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2008―2012奉化市成人麻疹临床分析与病毒基因特征研究

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2008―2012奉化市成人麻疹临床分析与病毒基因特征研究

摘要:目的:应用分子生物学方法检测奉化市2008-2010年成人感染麻疹病毒,分析麻疹病毒基因特性,了解成人麻疹的发病原因,为麻疹监测和防治提供依据。方法:收集100例成人麻疹患者的咽拭子和血清,应用逆转录-聚合酶链反应扩增麻疹野毒株的核蛋白(N)基因碳末端的456个核苷酸并进行核苷酸序列测定,与基因库中按照病毒各基因型参考株比较并分析毒株变异情况。结果:奉化市成人麻疹临床表现典型,分离到的麻疹病毒均为H1基因型,与H1型参考株的核苷酸同源性为97.1%-98.0%,与中国疫苗株沪191的核苷酸/氨基酸差异为8.0-9.0%/9.8-14.5%。

关健词:成人麻疹 流行病学 病毒基因 资料与方法

一、 研究对象

二、 方法

2.1、病毒RNA提取

取出三个样品(麻疹病毒不同分离株,-80℃冻存,取至上海分子病毒实验室)和一个标准株作阳性对照。麻疹减毒活疫苗沪191(取至上海疾控中心),采用德国QIAGEN公司的Rneasy Mini Kit,按试剂盒说明书提取麻疹RNA

2.2、引物

2.3、逆转录-聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)

2.4、核苷酸序列测定及分析

扩增后产物送上海Invitrogen公司进行序列测定,测序结果的序列拼接、处理分析使用了DNA BSTAR软件,其余参比的代表株序列均来自基因库(GenBank)。

3结果

3.1、入组病例临床资料分析

3.2、基因亲圆形关系树

将所测得的3株麻疹野病毒N基因碳末端的456bp核苷酸序列与Genebank中麻疹病毒各基因型参考株进行比对,明确本研究中分离到的3株麻疹病毒基因型均为H型,与中国流行的基因型一致。有图3可见,3株麻疹病毒均属H1基因型中的H1a亚型,与其他参考株之间存在较大的差异。

3.3、序列分析及同源性

4讨论

参考文献:

[3]Itoh M ,okumo Y,Hotta H.Comparative analysis of titers of antibody against measles virus in sera of vaccinated and naturally infected Japanese individuals of different age groups [S] .Jclin microbial ,2002,40(5):1733-1738.

[4]Itoh M ,okumo Y,Hotta H.Comparative analysis of titers of antibody against measles virus in sera of vaccinated and naturally infected Japanese individuals of different age groups [S] .Jclin microbial ,2002,40(5):1733-1738.

[5]王海明,源荣定,徐永范等,奉化市人群麻疹抗体水平监测及初中学生麻疹疫苗加强接种效果观察,中国预防医学杂志,2008,9(4):256-262.

[6]WHO .New genotype of measles virus and update on global distribution on measles genotypes .Wkly Epidemiol Rec ,2005,80:347-351.

[7]张燕,许文波,朱贞等,中国2003年流行的麻疹野病毒分子流行病学分析[J],中国计划免疫,2005,11(3):165-174.

[8]姬奕昕,许文波,时燕等,中国6个省2005年麻疹病菌分离株分子特征分析[J],病毒学报,2005,2005,21(6):407-415.

[9]严菊英,卢亦愚,时建华,等,浙江省麻疹病毒分离株的基因特性与免疫原型研究[J],中国病毒学,2006,,2(1):1-5.

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