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荧光定量RT-PCR步骤

上传者:黄春雷
|
上传时间:2015-05-05
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荧光定量RT-PCR步骤

荧光定量real-time PCR反应步骤

一、RNA的抽提(捷瑞试剂盒GK3011)

准备:

1. 95%乙醇184ml+ DEPC水至250ml(70%),擦拭台面(量筒、250ml瓶DEPC处理)

2.配置2ml氯仿/异戊醇(960ul﹕40ul)2管,20次

3.配置RPE Solution液,RPE/无水乙醇(180ul﹕720ul)10管,20次

4.恒温加热器调整到65℃

提取:

1.细胞(10)消化离心,转移至1.5mlEppendorf管内,离心,去上清

2.1mlHanks液稀释、吹散,取25ul细胞计数(约10/L)结果乘以0.01即细胞量,其余细胞离心,去上清,加入0.5mlTrizol

3.1ml注射器抽吸,裂解细胞后,加入100ul氯仿/异戊醇,剧烈震荡混匀30sec,12000rpm,5min

4.上清液转移到另一Eppendorf管内加入150ul无水乙醇混匀

5.将全部溶液(包括沉淀)转移到套放于2ml收集管内的GenClean柱内,室温放置2min,12000rpm,1min

6.取出柱子弃去废液,再将柱子放回收集管内加入450ulRPEsolution,12000rpm,30sec,并重复一次

7.取出柱子弃去废液,再将柱子放回收集管内10000rpm,30sec

8.取出柱子,放入Eppendorf管内,柱内膜中心加入40ulDEPC-H2O(包装盒内的),65℃,2min

9.12000rpm,1min,管内即为RNA样品,-70℃保存。 96

*10细胞约可提RNA100ug

*1OD260=40mg RNA,浓度=(OD260-OD320)×稀释倍数×0.04ug/ul

*RNA的分析定量:测定在260和280nm的OD值(TE Buffer稀释),OD260/280=1.8~2.0视为提取的RNA纯度很高,小则蛋白质污染,大则RNA被水解。

*肌肉细胞的trizol使用量应该加大

二、RT反应

1.在microtube管内加入如下反应液(冰上)

内容需要下载文档才能查看

2.65℃ 5min, 冰上急冷(﹥1min)

3.再向管内加入如下反应液(冰上)

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4.逆转录反应

1.30℃10min(用Random 6 mers时,用Olig dT省去此步),2.42℃(到50℃之间)45min,3.70℃15min,4.降温到4℃ 6

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