教育资源为主的文档平台

当前位置: 查字典文档网> 所有文档分类> 高等教育> 生物学> SARS_CoVS蛋白抗原表位多肽的设计合成与免疫反应

SARS_CoVS蛋白抗原表位多肽的设计合成与免疫反应

上传者:罗玉宏
|
上传时间:2015-04-26
|
次下载

SARS_CoVS蛋白抗原表位多肽的设计合成与免疫反应

?40?文章编号:1008-9926(2005)01-0040-03  中图分类号:R914.5  文献标识码:A

SARS2CoVS蛋白抗原表位多肽的设计合成与免疫反应

张嘉杰②,吴少瑜,徐 伟,吴曙光

(中国人民解放军第一军医大学药物研究所 广东 广州 510515)

摘 要:目的 通过生物信息学与合成多肽方法,寻找SARS2CoVS蛋白的抗原表位,为抗SARS多肽疫苗的深入研究提供试验依据。方法 利用网络共享软件对与S蛋白抗原性相关的参数进行预测分析,从而设计S蛋白的抗原表位多肽;将合成的抗原表位多肽免疫家兔,用ELISA法检测产生的抗体。结果 ELISA法检测发现,设计合成的2个抗原表位多肽片段(残基3482

380,4342470)在家兔体内均能诱导抗体产生。结论 设计合成的2个抗原表位多肽片段中包含SARS2S蛋白的抗原表位,

免疫家兔后能产生特异性抗体。

关键词:SARS冠状病毒;S蛋白;抗原表位;多肽疫苗

DesignsynthesisandimmuereactionSARS2CoVspikeprotein

ZHANGJia2Jie,WUShao2Yu,XUWeiG(InstituteofPharmaceuticUniversity,Guangzhou 510515,Guangdong China)ABSTRACTtheepitopesofSproteintodeveloppeptidevaccineagainstSARS2CoVinfection,wede2signedandepitopepeptidesofSproteinbycombineduseofbioinformaticalandstructuralanalysis.MethodsEpitopepeptidesofSproteinweredesignedandsynthesizedafterpredictingandanalyzingtherelationalparametersoftheantigenicityofSproteinwithonlinesharingsoftwareandrabbitswereimmunizedwiththesesyntheticpeptides.AntibodiesweretestedbyELISA.ResultsBothoftwosyntheticpeptides(aminoacidresidues3482380,4342470)elicitedspecificantibodies.ConclusionTowsyntheticpeptidescanelicitspecificantibodiesinrabbits,whichmayimplythattheycontaintheepitopesequencesofSproteinofSARS2CoV.

KEYWORDS:SARScoronavirus;Spikeprotein;Epitope;Peptidevaccine

  严重急性呼吸道综合征(severeacuterespiratorysyndrome,SARS)是一种新型的强传染性和高死亡率疾病,其病原体为一种新的冠状病毒(SARSCoron2avirus,SARS2CoV)[1]。由于将冠状病毒制成的灭活疫苗或减毒疫苗在正常人体应用时存在潜在的危险性,而且对不同病毒株免疫性存在差异[2],因此从长远利益考虑,针对性强、安全性高的多肽疫苗成为了SARS疫苗研究的重点之一。研究抗SARS多肽疫苗的关键是从SARS冠状病毒的功能蛋白序列中找出有免疫原性的抗原表位或抗原决定簇,作为免疫原来研究抗SARS疫苗。运用生物信息学技术对抗原蛋白的抗原表位进行预测,是确定抗原表位最有效的方法。S蛋白(Spikeprotein)是位于SARS2CoV表面的一种重要的结构蛋白,在病毒与宿主细胞表面受体结合及介导膜融合并进入细胞的过程中起关键性作用[3],包含病毒与宿主细胞膜受体的结合位

点和主要的中和抗原,是进行抗SARS疫苗设计的重要位点[4]。我们运用生物信息学技术对S蛋白的抗原表位进行预测分析与设计,并合成出设计的候选抗原表位多肽用于免疫家兔,检测分析免疫家兔抗体的产生情况,以发现S蛋白的抗原表位。1 材料与方法

1.1 试剂 Fmoc-氨基酸、HBTU、HOBt(吉尔生化

有限公司),哌啶

内容需要下载文档才能查看

、N-甲基吡咯酮、二氯甲烷(ABI公司),三氟乙酸(Sigma公司),牛血清白蛋白(上海伯奥生物科技有限公司),马血清(GibcoBRL公司),羊抗人IgG(Sigma公司),对硝基苯磷酸盐(pNPP,Sigma公司),96孔酶联板(Corning公司)。1.2 仪器 多肽合成仪(433A,ABI公司),液质联用仪(API?2000,ABI公司),高效液相色谱仪(Al2liance2695,Waters公司),冷冻干燥机(Labconco公

①基金项目:广东省科技厅科研攻关项目SARS专项基金。

②作者简介:张嘉杰(1967-),男,湖南保靖人,在读博士研究生,助理研究员。研究方向:免疫药理学。Tel:13660019832;E-mail:jydyys

@http://wendang.chazidian.com

© 1994-2009 China Academic Journal Electronic Publishing House. All rights reserved. http://wendang.chazidian.com

?41?

司),酶标仪(650,Bio-Rad公司)。蛋白抗原性相关的参数进行预测与分析,结果表明

1.3 动物 新西兰家兔体重为2~3kg,♂(第一军在S蛋白中存在一个球状结构区域(S1区)和3个医大学动物试验中心提供,动物合格证号2003A058)。螺旋区(S2区),螺旋结构分别位于残基729~769,1.4 软件工具 Proteomicsandsequenceanalysistools880~1015,1163~1184。S蛋白的信号肽切割位(http://wendang.chazidian.com/)。点预测结果表明其位于N-端的13位氨基酸残基

(G1.5 方法ly)和14位氨基酸(Ser)残基之间,即1~13位氨1.5.1 抗原表位多肽的预测与设计 利用Expasy

基酸残基为S蛋白的信号肽。S蛋白在1196~1218之间存在一段穿膜螺旋结构,1~1195段处于胞

提供的网络共享工具软件,提交S蛋白的氨基酸序

列在网上对S蛋白的二级结构、信号肽切割位点、穿

β膜螺旋、N-糖基化位点、亲水性、可及性、2转角等

进行预测。综合上述预测结果,设计抗原表位多肽。1.5.2 抗原表位多肽的合成 设计的2个抗原表位多肽采用Fmoc-butyl固相合成侧链保护策略,肽合成仪上进行合成,选用HBTU/HOBt剂。粗肽在HPLC1氟乙酸/HPLC纯度95%以上)谱分析以确定结构1.5.3 家兔免疫 采用浓度为1mg?ml-1的抗原多肽对家兔进行免疫。初次免疫采用剂量为抗原多肽和弗氏完全佐剂(CFA)各1ml,双后足掌及背部各2点sc。加强免疫剂量为抗原多肽和CFA或弗氏不完全佐剂(IFA)各0.5ml,间隔2周加强免疫一次,2种佐剂交替应用,皮下淋巴结注射。在第3次免疫后,每次免疫10d后进行耳静脉采血10ml,分离血清采用间接ELISA法测定免疫血清的抗体效价。1.5.4 ELISA法检测抗体 用0.05mol?L-1碳酸盐

μ缓冲液(pH9.6)的包被液将抗原多肽按100l/孔包

μgml-1,4℃被96孔酶联板包被,浓度20过夜;次日洗涤3次,洗涤液为含0.05%Tween-20的0.02mol

?L-1的PBS(pH7.4);用含10%马血清的洗涤液作为封闭液封闭60min后,再洗涤3次;分别加入按1∶25,1∶100,1∶400,1∶800,1∶1600,1∶3200稀释的免疫

μ家兔血清100l,免疫前家兔的血清作为阴性对照,37℃孵育60min;洗涤3次,加入羊抗人IgG-

膜外,1219~1255则在胞膜内蛋白共有23个N

糖基化位点,其中有10。S,,即75~95,372~478,481~515,610~825,1095~1140,1202~1242。7个亲水性较高的区域,即166~212,260~348,367~470,507~572,749~772,1118~1152,1229~1252。S蛋白在残基459~470存在明

显的β2转角。综合考虑上述预测分析结果,设计了表1中的2个片段作为抗原多肽进行研究。

表1 抗原表位多肽的氨基酸序列

Tab1 Aminoacidsequencesofepitopepeptides

序号

SV21SV22

位置

348~380434~470

氨基酸序列

CVADYSVLYNSTFFSTFKCYSVSATKLNDLCFSGNYNYKYRYLRHGKLRPFEDDISNVPFSPDGKPC

相对分子质量

3726.74048.2

2.2 家兔免疫与抗体的检测 家兔第1次免疫后,

即有免疫反应产生,出现淋巴结肿大现象,随后的加

强免疫部位均在淋巴结上。第3次免疫后10d进行第1次采血,并进行抗体的ELISA检测。结果表明抗体产生的滴度不高。继续免疫后,抗体滴度不断上升,至第6次免疫后,产生抗体的滴度与第5次基本相同,产生抗体滴度达到最大,停止免疫。第6次免疫后,ELISA检测抗体产生的结果见图1、2。检测结果表明免疫后的家兔血清呈明显的阳性反应,稀释3200倍后仍然呈阳性反应。3 讨论

μAP100l,37℃孵育60min,加入底物对硝基苯磷酸盐,37℃孵育10min,终止反应,于酶标仪上测定

450nm处的吸收度。2 结果

2.1 抗原表位多肽的设计 SARS2CoV的S蛋白是

既往对蛋白抗原表位的确定,是通过顺序重叠

合成整个抗原蛋白的多肽片段

内容需要下载文档才能查看

,然后,再进行免疫反应检测来进行。这种方法很准确,但却需要大量的试验时间和费用。近年来,运用生物信息学技术对功能蛋白的抗原表位进行预测,为抗原表位的确定节约了大量的时间和经费,大大提高了试验的预见性和成功率。预测分析主要包括与蛋白抗原性相关

β的二级结构、可及性、亲水性、2转角、信号肽切割位

病毒表面最大的结构蛋白,其由1255个氨基酸残

基组成。根据全基因测序结果翻译的S蛋白的氨基酸序列,利用Expasy提供的网络共享工具软件对S

© 1994-2009 China Academic Journal Electronic Publishing House. All rights reserved. http://wendang.chazidian.com

内容需要下载文档才能查看

?42抗原表位多肽时应该尽量避开这些糖基化可能性高

的位点。综合上述预测与分析结果,我们设计并合成了SV21和SV22作为抗原表位多肽进行研究。

家兔的免疫试验表明,笔者设计合成的抗原多肽均产生了其特异性抗体。说明SV21和SV22中存在S蛋白的抗原表位,证明通过生物信息学方法进行抗原表位的研究是一种很有效的方法,为抗SARS的多肽疫苗深入研究提供了新的试验依据。对SARS2CoV最新的研究成果表明,S蛋白以其318~510共193ACE2(angiotensin

6-,S蛋白的受21和SV22在家兔体内产生的抗SARS2CoV,还需要进一步研究。

参考文献:

[1] KsiazekTG,ErdmanD,GoldsmithCS,etal.SARSWorkingGroup.A

novelcoronavirusassociatedwithsevereacuterespiratorysyndrome[J].NEnglJMed,2003,348(20):1953

[2] PratelliA,TinelliA,DecaroN,etal.Safetyandefficacyofamodified

-livecaninecoronavirusvaccineindogs[J].VetMicrobiol,2004,99(1):43

[3] RotaPA,ObersteMS,MonroeSS,etal.Characterizationofanovel

coronavirusassociatedwithsevereacuterespiratorysyndrome[J].

Science,2003,300(5624):1394

图1 SV21免疫家兔血清抗体的 图2 SV22免疫家兔血清抗体的滴度 

滴度

Fig1 Titrationofantibodiesfrom Fig2 TitrationofantibodiesfromrabbitserumimmunizedwithSV21 rabbitserumimmunizedwithSV22

点、穿膜螺旋、N-糖基化位点等。SS1球状结构,位于病毒的最外层过S1,液中呈伸展状态,有更多的机会与宿主细胞结合。同时具有较好的亲水性和可及性的片段更易于接近宿主细胞受体和游离的抗体分子。因此,笔者认为位于S1区的3个片段(303~338,372~393,451~470)包含抗原表位的可能性很大。脯氨酸侧链是疏水性的,但因其善于制造转角,而常常在蛋白的表面

2转角预测结果表明466位的脯氨出现。S蛋白的β

酸(Pro)制造了一个明显的β2转角,属脯氨酸转角类型。在抗原表位的筛选和确定时,脯氨酸是一个重要的氨基酸。S蛋白的信号区,是一疏水性的肽段。该肽段在S蛋白通过内质网转运的过程中脱离,不构成S蛋白的抗原表位。1196~1218之间的一段穿膜螺旋结构和1219~1255的胞膜内区由于不可能与宿主细胞结合,也不构成S蛋白的抗原表位。预测的S蛋白23个糖基化位点中有10个位点的糖基化可能性很高,为了避免糖基化的影响,在设计合

[4] GallagherTM,BuchmeierMJ.Coronavirusspikeproteinsinviralentry

andpathogenesis[J].irology,2001,279(2):371

[5] LiW,MooreMJ,VasilievaN,etal.Angiotensin-convertingenzyme

2isafunctionalreceptorfortheSARScoronavirus[J].Nature,2003,426(6965):450

[6] WongSK,LiW,MooreMJ,etal.A193-aminoacidfragmentofthe

SARScoronavirusSproteinefficientlybindsangiotensin-convertingenzyme2[J].JBiolChem,2004,279(5):3197

(收稿日期:2004-09-01;修回日期:2004-11-15)

(本文编辑 梁爱君)

文章编号:1008-9926(2005)01-0042-05  中图分类号:R965.1  文献标识码:A

化学性及免疫性肝损伤模型的方法学研究

黄正明②,杨新波③,曹文斌,陈红艳③,李 壮④

(②中国人民解放军第302医院 药学部 北京 100039;③中国人民解放军总医院 老年医学研究所 北京 100853;④中国

医学科学院医药生物技术研究所 病毒室 北京 100083

内容需要下载文档才能查看

)

摘 要:目的 在有关经典模型的基础上,探索和改良化学性肝损伤模型,为防治乙肝药物的研究提供合适的试验方法。方

①基金项目:国家科技部“九?五”科研基金项目,No.96-901-05-016

②作者简介:黄正明(1949-),男,河南商丘人,教授、硕士和博士生导师。研究方向:实验药理学。Tel:(010)66933233

© 1994-2009 China Academic Journal Electronic Publishing House. All rights reserved. http://wendang.chazidian.com

版权声明:此文档由查字典文档网用户提供,如用于商业用途请与作者联系,查字典文档网保持最终解释权!

下载文档

热门试卷

2016年四川省内江市中考化学试卷
广西钦州市高新区2017届高三11月月考政治试卷
浙江省湖州市2016-2017学年高一上学期期中考试政治试卷
浙江省湖州市2016-2017学年高二上学期期中考试政治试卷
辽宁省铁岭市协作体2017届高三上学期第三次联考政治试卷
广西钦州市钦州港区2016-2017学年高二11月月考政治试卷
广西钦州市钦州港区2017届高三11月月考政治试卷
广西钦州市钦州港区2016-2017学年高一11月月考政治试卷
广西钦州市高新区2016-2017学年高二11月月考政治试卷
广西钦州市高新区2016-2017学年高一11月月考政治试卷
山东省滨州市三校2017届第一学期阶段测试初三英语试题
四川省成都七中2017届高三一诊模拟考试文科综合试卷
2017届普通高等学校招生全国统一考试模拟试题(附答案)
重庆市永川中学高2017级上期12月月考语文试题
江西宜春三中2017届高三第一学期第二次月考文科综合试题
内蒙古赤峰二中2017届高三上学期第三次月考英语试题
2017年六年级(上)数学期末考试卷
2017人教版小学英语三年级上期末笔试题
江苏省常州西藏民族中学2016-2017学年九年级思想品德第一学期第二次阶段测试试卷
重庆市九龙坡区七校2016-2017学年上期八年级素质测查(二)语文学科试题卷
江苏省无锡市钱桥中学2016年12月八年级语文阶段性测试卷
江苏省无锡市钱桥中学2016-2017学年七年级英语12月阶段检测试卷
山东省邹城市第八中学2016-2017学年八年级12月物理第4章试题(无答案)
【人教版】河北省2015-2016学年度九年级上期末语文试题卷(附答案)
四川省简阳市阳安中学2016年12月高二月考英语试卷
四川省成都龙泉中学高三上学期2016年12月月考试题文科综合能力测试
安徽省滁州中学2016—2017学年度第一学期12月月考​高三英语试卷
山东省武城县第二中学2016.12高一年级上学期第二次月考历史试题(必修一第四、五单元)
福建省四地六校联考2016-2017学年上学期第三次月考高三化学试卷
甘肃省武威第二十三中学2016—2017学年度八年级第一学期12月月考生物试卷

网友关注

2019云南公务员考试常识判断40000问(一百三十)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百三十三)
2019云南公务员考试行测题库:资料分析练习题答案(二)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百一十四)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百三十四)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百零四)
2019云南公务员考试行测题库:言语理解练习题(四)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百三十二)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百一十一)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百零七)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百二十七)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百一十五)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百零五)
2019云南公务员考试常识判断40000问(九十九)
2019云南公务员考试行测题库:资料分析练习题(二)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百一十)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百零一)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百一十八)
2019云南公务员考试行测题库:言语理解练习题答案(三)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百零二)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百二十二)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百二十四)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百一十九)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百零六)
2019云南公务员考试常识判断40000问(一百三十五)
2019云南公务员考试常识判断40000问(九十六)
2019云南公务员考试常识判断40000问(九十五)
2019云南公务员考试常识判断40000问(九十八)
2019云南公务员考试行测题库:言语理解练习题答案(四)

网友关注视频

每天日常投篮练习第一天森哥打卡上脚 Nike PG 2 如何调整运球跳投手感?
冀教版小学英语四年级下册Lesson2授课视频
19 爱护鸟类_第一课时(二等奖)(桂美版二年级下册)_T3763925
沪教版牛津小学英语(深圳用) 五年级下册 Unit 12
冀教版小学数学二年级下册第二周第2课时《我们的测量》宝丰街小学庞志荣
【部编】人教版语文七年级下册《老山界》优质课教学视频+PPT课件+教案,安徽省
冀教版小学数学二年级下册第二单元《余数和除数的关系》
外研版英语七年级下册module3 unit2第二课时
第12章 圆锥曲线_12.7 抛物线的标准方程_第一课时(特等奖)(沪教版高二下册)_T274713
二年级下册数学第三课 搭一搭⚖⚖
【部编】人教版语文七年级下册《泊秦淮》优质课教学视频+PPT课件+教案,广东省
第五单元 民族艺术的瑰宝_16. 形形色色的民族乐器_第一课时(岭南版六年级上册)_T1406126
北师大版数学四年级下册3.4包装
冀教版英语三年级下册第二课
【部编】人教版语文七年级下册《逢入京使》优质课教学视频+PPT课件+教案,安徽省
苏教版二年级下册数学《认识东、南、西、北》
3.2 数学二年级下册第二单元 表内除法(一)整理和复习 李菲菲
苏科版八年级数学下册7.2《统计图的选用》
化学九年级下册全册同步 人教版 第22集 酸和碱的中和反应(一)
《小学数学二年级下册》第二单元测试题讲解
沪教版牛津小学英语(深圳用) 五年级下册 Unit 10
沪教版牛津小学英语(深圳用) 四年级下册 Unit 8
外研版英语三起6年级下册(14版)Module3 Unit1
二年级下册数学第一课
沪教版八年级下次数学练习册21.4(2)无理方程P19
沪教版牛津小学英语(深圳用) 四年级下册 Unit 4
七年级下册外研版英语M8U2reading
冀教版英语四年级下册第二课
第19课 我喜欢的鸟_第一课时(二等奖)(人美杨永善版二年级下册)_T644386
3月2日小学二年级数学下册(数一数)