小型猪和小鼠等医学实验哺乳动物模型建立与基础数据集成
上传者:贾永君|上传时间:2015-05-05|密次下载
小型猪和小鼠等医学实验哺乳动物模型建立与基础数据集成
项目名称: 小型猪和小鼠等医学实验哺乳动物模型起止年限:
依托部门:建立与基础数据集成 于军 中国科学院北京基因组研究所 2011.1
至2015.8 中国科学院 首席科学家:
二、预期目标
总体目标:
深入开展医用小型猪和小鼠的基因组学、转录组学、免疫组学等相关组学的系
统化研究,获取与发育、生殖、生理(包括对应动物模型的病理机制)等相关信
息,结合灵长类和其他哺乳类公共数据,建立相应的专业数据库,完善小型猪基
因修饰的相关技术平台,推动小型猪医用模型的研究,同时也为人类疾病研究和
猪遗传育种开辟可持续发展的路线图。本项目将通过“四个整合”即整合团队、整
合技术、整合信息和整合资源,建立具有我国特色的哺乳动物系统组学数据整合
与共享平台,建立一支能够长期紧密合作的、具有领导科学前沿能力的和能够整
合不同领域和研究部门资源的研究团队,并为以建立以我国科学家为主体的联合
研究体(Consortium)奠定科学和组织基础。
五年预期目标:
1. 完成两个小型猪(巴马香猪和藏猪)的基因组序列图。完成10 种不同小型
猪、野猪和代表性家养猪种不同覆盖度的基因组序列。发现100 万以上基因组
多态性标记(包括SNP、CNV 和其它标记,如STR 等)。确定10 万高频率、候选
功能SNP,建立若干群体的单倍体型图。
2. 从各类小型猪及其疾病模型中获取整合型组学数据,建立研究方法和获取基
本数据。
3.
4.
5. 建立并维护哺乳动物基因组数据库,使之成为重要的原始和整合型数据库。
建立1 到2 个人类疾病的小型猪模型(动脉硬化、多囊肾)。 以若干个小型猪、
小型猪疾病模型和小鼠疾病模型为出发点,深入研究这些
模型在病理和生理状态下的转录组,获取与代谢组学、生殖组学、免疫组学等
相关信息
,构建基因调控网络模型。
6.
7. 建立至少一种猪的基因修饰新方法。 通过基因剔除技术建立小鼠突变模型,
在体内研究这些序列的功能,特别是
分析这些模型对基因组的表观遗传修饰的影响。
8. 建立基因剔除小鼠模型60 种,其中包括40 种非编码RNA 基因剔除小鼠和
20 种非编码大片段保守序列的剔除小鼠。
9. 培养和造就一批中青年学术带头人和不同层次的科技新人,其中包括硕士研
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