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小型猪和小鼠等医学实验哺乳动物模型建立与基础数据集成



 项目名称: 小型猪和小鼠等医学实验哺乳动物模型起止年限:
 依托部门:建立与基础数据集成 于军 中国科学院北京基因组研究所 2011.1
至2015.8 中国科学院 首席科学家:



 二、预期目标
 总体目标:
 深入开展医用小型猪和小鼠的基因组学、转录组学、免疫组学等相关组学的系
统化研究,获取与发育、生殖、生理(包括对应动物模型的病理机制)等相关信
息,结合灵长类和其他哺乳类公共数据,建立相应的专业数据库,完善小型猪基
因修饰的相关技术平台,推动小型猪医用模型的研究,同时也为人类疾病研究和
猪遗传育种开辟可持续发展的路线图。本项目将通过“四个整合”即整合团队、整
合技术、整合信息和整合资源,建立具有我国特色的哺乳动物系统组学数据整合
与共享平台,建立一支能够长期紧密合作的、具有领导科学前沿能力的和能够整
合不同领域和研究部门资源的研究团队,并为以建立以我国科学家为主体的联合
研究体(Consortium)奠定科学和组织基础。

 五年预期目标:
 1. 完成两个小型猪(巴马香猪和藏猪)的基因组序列图。完成10 种不同小型
 猪、野猪和代表性家养猪种不同覆盖度的基因组序列。发现100 万以上基因组
多态性标记(包括SNP、CNV 和其它标记,如STR 等)。确定10 万高频率、候选
功能SNP,建立若干群体的单倍体型图。
 2. 从各类小型猪及其疾病模型中获取整合型组学数据,建立研究方法和获取基
 本数据。
 3.
 4.
 5. 建立并维护哺乳动物基因组数据库,使之成为重要的原始和整合型数据库。
建立1 到2 个人类疾病的小型猪模型(动脉硬化、多囊肾)。 以若干个小型猪、
小型猪疾病模型和小鼠疾病模型为出发点,深入研究这些
 模型在病理和生理状态下的转录组,获取与代谢组学、生殖组学、免疫组学等
相关信息 ,构建基因调控网络模型。
 6.
 7. 建立至少一种猪的基因修饰新方法。 通过基因剔除技术建立小鼠突变模型,
在体内研究这些序列的功能,特别是
 分析这些模型对基因组的表观遗传修饰的影响。



 8. 建立基因剔除小鼠模型60 种,其中包括40 种非编码RNA 基因剔除小鼠和
 20 种非编码大片段保守序列的剔除小鼠。
 9. 培养和造就一批中青年学术带头人和不同层次的科技新人,其中包括硕士研

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