网络Meta分析在R软件中的实现

网状Meta

２０１２年６月第１２卷第３期

循证医学

ＴｈｅＪｏｕｒｎａｌｏｆＥｖｉｄｅｎｃｅ—ＢａｓｅｄＭｅｄｉｅｉｎｅ

Ｊｕｎ．２０１２Ｖ０１．１２

Ｎｏ．３

?循证医学中的医学统计学问题?

熊

茜８

（上海市静安区中心医院ａ．科教部；ｂ．中医科，上海２０００４０）

［摘要］

慰剂进行直接和间接比较，进行网络Ｍｅｔａ分析。结果直接和间接比较结果表明，所有药物较之于安慰剂均可以减少人类免疫缺陷病毒感染者出现复合鸟分支杆菌事件发生，克拉霉素和阿奇霉素较之于利福平均可以减少人类免疫缺陷病毒感染者出现复合鸟分支杆菌事件发生：而对无直接比较证据的克拉霉素与阿奇霉素，间接比网络Ｍｅｔａ分析方法合并直接和间接比较结果是一种正规的方法。

［关键词］

网络Ｍｅｔａ分析；线性混合效应模型；间接比较；Ｒ软件

［文献标识码］Ａ

［文章编号］

１６７１—５１４４（２０１２）０３—０１８５—０４

［中图分类号］Ｒ１９５．１

Ｎｅｔｗｏｒｋ

Ｍｅｔａ－Ａｎａｌｙｓｉｓ

ａｎｄＩｔｓＳｏｌｕｔｉｏｎｂｙＲ

Ｑｉａｎ８

ＺＨＡＮＧＴｉａｎ—ｓｏｎ９８一．ＸＩＯＮＧ

（ａ．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＳｃｉｅｎｃｅ＆Ｅｄｕｃａｔｉｏｎ；ｂ．ＤｅｐａｒｔｍｅｎｔｏｆＴＣＭ，Ｊｉｎｇ’ａｎＤｉｓｔｒｉｃｔＣｅｎｔｒａｌＨｏｓｐｉｔａｌ，Ｓｈａｎｇｈａｉ２０００４０，Ｃｈｉｎａ）

Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ

ｉｎｔｒｏｄｕｃｅｍｅｔｈｏｄｏｌｏｇｙｆｏｒｕｎｄｅｒｔａｋｉｎｇ

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ｎｅｔｗｏｒｋｍｅｔａ—ａｎａｌｙｓｉｓａｎｄｉｔｓｒｅａｌｉｚａｔｉｏｎｉｎＲ．

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Ｒ，ｎｅｔｗｏｒｋｍｅｔａ—ａｎａｌｙｓｉｓｏｆｒａｎｄｏｍｉｚｅｄｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄｔｒｉａｌｓ（ＲＣＴｓ）ｗａｓｕｓｅｄ

ｃｏｍｂｉｎｅｄｉｒｅｃｔａｎｄｉｎｄｉｒｅｃｔｅｓｔｉｍａｔｅｓｏｆｔｈｅｅｆｆｅｃｔｏｆｔｈｒｅｅｄｒｕｇｓａｎｄｐｌａｃｅｂｏｆｏｒｍｙｃｏｂａｅｔｅｒｉｕｍａｖｉｕｍｃｏｍｐｌｅｘ（ＭＡＣ）ｉｎ

ｐａｔｉｅｎｔｓ

ｉｎｆｅｃｔｅｄｗｉｔｈｔｈｅｈｕｍａｎｉｍｍｕｎｏｄｅ胁ｉｅｎｃｙｖｉｒｕｓ（ＨＩＶ）ｆｒｏｍ５ＲＣＴｓ．Ｒｅｓｕｌｔｓ

ｅｖｅｎｔｓ

Ａｌｌｄｒｕｇｓｄｉｆｆｅｒｅｄｆｒｏｍｐｌａｃｅｂｏｉｎ

ｒｅｄｕｃｉｎｇＭＡＣ

ｆｒｏｍｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｏｆｄｉｒｅｃｔａｎｄｉｎｄｉｒｅｃｔｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓ．ＣｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｅｉｎａｎｄＡｚｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎｄｉｆｉｅｒｅｄｆｒｏｍ

ｅｖｅｎｔｓ

ＲｉｆａｂｕｔｉｎｉｎｒｅｄｕｃｉｎｇＭＡＣｆｒｏｍｔｈｅｒｅｓｕｌｔｓｏｆｄｉｒｅｃｔａｎｄｉｎｄｉｒｅｃｔｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓｒｅｓｐｅｃｔｉｖｅｌｙ．Ｔｈｅｉｎｄｉｒｅｃｔｅｆｆｉｃａｃｙｏｆ

ｎｏ

ＣｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎａｎｄＡｚｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎｈａｄ

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Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｎｅｔｗｏｒｋｍｅｔａ—ａｎａｌｙｓｉｓ；ｌｉｎｅａｒｍｉｘｅｄ—ｅｆｆｅｃｔｓｍｏｄｅｌ；ｉｎｄｉｒｅｃｔｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓ；Ｒ

过直接对比．这种分析方法可以将一系列不同治

照或阳性药物的随机对照试验是评价治疗效应的金标准，但在实际情况下，许多干预措施缺乏或没有直接比较的证据…。随着医学研究的进展，在没有直接证据时．越来越需要干预措施间接比较的

疗方法随机临床试验数据汇总，然后就给定的治疗终点进行点估计及可信区间估计，同时对非相

分析（ｎｅｔｗｏｒｋ２『，可以在多种统计软件中通过拟合线性混合效应模型而

接比较．即使是相比较的两种治疗药物从未进行

进行网络Ｍｅｔａ分析的具体过程。

［作者简介］张天嵩（１９７０一），男，山东昌邑人，医学博士，主任医师，副教授，主要从事呼吸系统疾病的中西医结合治疗及循证医学方法学研究。

１

数据来源

该方法需要数量较多的干预措施比较研究，

万方数据

网状Meta

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循证医学

２０１２年第１２卷第３期

但限于篇幅和简便说明起见，我们采用一简单数主要观察药物预防人类免疫缺陷病毒感染者出现复合鸟分支杆菌（ｍｙｅｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ

ａｖｉｕｍ

Ａｚｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ”直接比较的证据．但可以通过网络Ｍｅｔａ分析来计算出间接比较的证据。

ｃｏｍｐｌｅｘ，

ＭＡＣ）事件例数，其用药物、患者数、出现ＭＡＣ事件人数具体见表１。

表１实例数据

图１药物直接比较与间接比较网络图

２数据预处理

求。将数据整理成两两比较形式，共得到５个比较

从表１中可以看出，有“Ｒｉｆａｂｕｔｉｎ与Ｐｌａｃｅｂｏ”、“Ｃｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ与Ｐｌａｃｅｂｏ”、“Ａｚｉｔｈｒｏｍｙｅｉｎ与Ｐｌａｃｅｂｏ”、“Ｒｉｆａｂｕｔｉｎ与Ｃｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ”直接比较的

组，按经典方法，分别计算出两比较组的对数比数比（１０９０ｒ）及其标准误（ｓｅｌｏｇｏｒ）；将配对比较的药物数据见表２。

证据．图１中以实线表示，但无“Ｃｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｅｉｎ与

表２预处理后的数据

３网络Ｍｅｔａ分析的具体步骤

Ｍｅｔａ分析。具体过程如下：

第二步：读人数据，将表中的数据输入Ｅｘｃｅｌ表格中，输人完成后，将其另存为“文本文件（制表符分隔）（术．ｔｘｔ）”，并命名为“ｈｉｖ．ｍａ．ｔｘｔ”，假设存储在ｃ盘根目录下。在Ｒ软件命令输入窗口分别键入：

＞ｌｉｂｒａｒｙ（ｆｏｒｅｉｇｎ）

＞ｍｙｄａｔａ＜．ｒｅａｄ．ｔａｂｌｅ（”ｅ：／ｈｉｖ—ｍａ．ｔｘｔ”，ｈｅａｄｅｒ＝

“ｍｙｄａｔａ”的数据集，并经过处理，将两两比较的药

物结成对子，以便于进一步分析。

输入窗口分别键人：

＞ｌｉｂｒａｒｙ（ｎｌｍｅ）

＞ｌｍｅ

１＜－ｌｍｅ（１０９０ｒ～０＋Ｒｉｆａｂｕｔｉｎ＋Ｃｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ

ｒａｎｄｏｍ＝～１

ｔｒｔｐａｉｒ，ｄａｔａ＝ｍｙｄａｔａ，

＋Ｐｌａｃｅｂｏ，

ｗｅｉｇｈｔｓ＝ｖａｒＣｏｎｓｔＰｏｗｅｒ（ｆｏｒｍ＝－ｓｅｌｏｇｏｒ，ｆｉｘｅｄ＝ｌｉｓｔ（ｐｏｗｅｒ＝１）））

ＴＲＵＥ）

＞ｍｙｄａｔａ＜－ｔｒａｎｓｆｏｒｍ（ｍｙｄａｔａ，ｔｒｔｐａｉｒ

２

上述命令是载入“ｎｌｍｅ”扩展包，采用ｌｍｅ（）函

ｐａｓｔｅ

（，ｄｒｕｇｌ，ｄｎｌ９２））万方数据

网状Meta

一一呲一面～一一张天嵩，等．网络Ｍｅｔａ分析在Ｒ软件中的实现１８７三种药物分另４与其相对比较的ｌｏｇｏｒ及其标准误、相应Ｐ值，从而可以求得其间接比较的比数比（ｏｄｄｓｒａｔｉｏ．ＯＲ）及其９５％可信区间（ｃｏｎｆｉｄｅｎｃｅ

较的ＯＲ及９５％ＣＩ为１．０３（０．７６，１．３９）。两种药物预防ＭＡＣ事件出现直接和间接比较结果（ＯＲ及９５％Ｃ１）见表３。表中右上部分是直接比较的结果（横向排列药物为参照），“Ｃｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ”与“Ａｚｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ”没有直接比较的ｉｎｔｅｒｖａｌ，ＣＩ）．如得到“ＣｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎＶＳ．Ａｚｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ”间接比结果：左下部分以浅灰色为底标记的数据是间接比较的结果（纵向排列药物为参照）。直接比较和间接比较均提示三种药物均较之于“Ｐｌａｃｅｂｏ”、“Ａｚｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ”和“Ｃｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｅｉｎ”较之于

一一一～一一一“Ｒｉｆａｂｕｔｉｎ”可降低发生ＭＡＣ事件的风险，而且直

接比较和间接比较结果是一致的：而“Ａｚｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ”和“Ｃｌａｒｉｔｈｒｏｍｙｃｉｎ’’在降低ＭＡＣ发生风险方而无明显差异；同时还发现间接比较的结果更为精确些。

４讨论

～也一一～一～一‰～一一～一一５

万方数据～酡一渤在没有直接比较的证据或者在比较两个以上比较结果在理论上可能比直接比较结果准确，但其证据级别低于直接比较的证据ｃ引．如比较Ａ和ＢＢ干预措施效应量的间接比较结果，但其证据级别低于直接比较Ａ干预措施和Ｂ干预措施的证据级（ｍｕｌｔｉｐｌｅｔｒｅａｔｍｅｎｔｓｔｒｅａｔｍｅｎｔｍｅｔａ—ａｎａｌｙｓｉｓ，ＭＴＣ）”等‘５。，这来实现［２，６Ｉ。别，因此当两种证据都存在时，首先考虑使用直接但众多学者不断探讨间接比较Ｍｅｔａ分析方法学，ｍｅｔａ—网络Ｍｅｔａ分析是由Ｌｕｍｌｅｙ建立的一种用于果。该方法基于线性混合效应模型．包括两个随机

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循汪医学２０１２年第１２卷第３期

［１］Ｔｈｉｊｓ

［参考文献］

Ｖ，ＬｅｍｍｅｎｓＲ，ＦｉｅｕＷｓＳ?Ｎｅｔｗｏｒｋ

ｍｅｔａ－ａｎａｌｙｓｉｓ：

慕１：：＝：。ｒｅｉ。ｃ。ｔ‰ａ－ａｎ血ａｌｙｓ叭ｉｓ。兰：；＝：。８焉节矾繁淼。；ｉ

２００８．２９（９）：１０８６—１０９２．

能估算不相关性１２］，但未提供不相关性大小的切

割点。Ｒ软件属于ＧＮＵ系统的一个自由、免费、开

［２］Ｌｕｍｌｅｙ

Ｔ－

ｍｅｔａ—ａｎａｌｙｓｉｓ

ｆｏｒｉｎｄｉｒｅｍⅡｅａ“ｎ”‘

源软件，是一套完整的数据处理、计算和绘图软件

系统．大多数经典的统计方法和最新的技术都可ｄｉｒｅｃｔ

以在Ｒ中直接得到，Ｒ１４．１自带“ｎｌｍｅ”包，目前最新版本为３．１－１０３，可以拟合线性和非线性混

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…ｃｃｏ。ｍ。ｐＪａｒ，ｉ８蔷篡．Ｃ言？‘Ｉ：；。ｅｄ。，ｄｂ２。０昭０２Ｋ，Ａ２１，（１：？：ｉ３１篡惫。。。，。。

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ａ１．ＧＲＡＤＥ

ｇ。ｉｄｅｌｉ。：

Ｃｌｉｎ

合模型，其中ｌｉｎｅ（）函数的基本功能为拟合线性８．Ｒａｔｉｎｇ

混合效应模型，可以实现ＬｕｍｌｅＹ氏法间接比较，

ｅＶｉｄ…ｅ—ｉｎｄｉｒｅｃｔｎｅｓｓ［Ｊ］．Ｊ

具体参数用法详见“ｎｌｍｅ”包的说明文件Ⅲ，在此

不赘述。

㈧篙罴ｉＩＺｌｌ嚣：２：。１７譬０３１０ｊ础糟ｎ。Ｈ。。ｄｂ。。。凡，

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Ｍａｒｃｈ２０１

法。进行间接比较时。针对收集到的临床研究及数据，需要评价其同质性、相似性和一致性，这对于确保结果的有效性和可靠性非常重要‘８Ｉ。

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１］．ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｃｏｃｈｒａｎｅ—ｈａｎｄｂｏ。ｋ．ｏｒｇ

［７］Ｐｉｎｈｅｉｒｏ

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［收稿ＩＥＩＩｔｌＩ］２０１２—０２—１７

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《循证医学》杂志征稿、征订通知

《循证医学》杂志是经国家新闻出版署批准，

广东省卫生厅主管．由广东省循证医学科研中心、广东省人民医院和中山大学附属第三医院主办的医学学术期刊。２００３年被评为“（ＣＮＫＩ中国期刊全文数据库》”、“万方数据一数字化期刊群”、“中

华首席医学网”全文收录期刊，“中国学术期刊综

本刊以临床实践指导性为特色，设置的主要

合评价数据库”统计源期刊，《中国科学引文数据库》、《中国生物医学文献数据库》、《中国核心期刊

（遴选）数据库》、《中文生物医学期刊文献数据

栏目有：先睹为快、述评、特别报告、循证评价、论著（包括诊断性研究、疗效研究、病因学研究、疾病的预后研究等）、证据的寻求与评价、循证医学中的医学统计学问题、临床试验、循证医学理论与方法研究、综述与讲座、循证医学在线、临床指引与共识、教育与争鸣、转化医学、循证病例讨论等。诚挚欢迎投稿。

全国各地邮政局发行，邮发代号４６．３２６。国际标准刊号ＩＳＳＮ１６７１—５１４４，国内统一刊号ＣＮ

４４—

库》、《中国生物医学期刊引文数据库》、《中文科技

期刊数据库》来源期刊，２００４年３月被中国科学

１５４８／Ｒ。《循证医学》杂志为双月刊、大１６开本、６４

技术信息研究所评定为“中国科技论文统计源期

刊（中国科技核心期刊）”。２００５年５月荣获首届

页，国内定价每期１０元，全年６０元。欲订阅者请

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（ＣＡＪ．ＣＤ规范》执行优秀期刊奖。

主编吴一龙（广东省人民医院副院长、广东省

人民医院肿瘤中心主任、广东省肺癌研究所所长、广东省循证医学科研中心主任，中山大学、南方医科大学、汕头大学、广东省心血管病研究所肿瘤学教授，博士生导师）。本刊以广大医药卫生技术人员和医疗、教学、科研管理工作者为读者对象，立足临床医学，介绍循证医学的理念、方法及相关知识．探讨符合中国国情的循证医学实践，促进国内

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